Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms