Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PEX2P28328 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PEX2P28328 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms