Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms