Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCLP19338 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCLP19338 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCLP19338 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCLP19338 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms