Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB1P14653 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB1P14653 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms