Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL2A1P02458 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL2A1P02458 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms