Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24BO95487 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms