Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF6O75683 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF6O75683 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF6O75683 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF6O75683 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF6O75683 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF6O75683 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SURF6O75683 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SURF6O75683 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF6O75683 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF6O75683 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF6O75683 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF6O75683 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SURF6O75683 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SURF6O75683 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SURF6O75683 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SURF6O75683 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms