Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX15O60248 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms