Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms