Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DFFAO00273 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DFFAO00273 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DFFAO00273 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DFFAO00273 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DFFAO00273 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DFFAO00273 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DFFAO00273 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms