Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM200CA6NKL6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms