Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLEC4AQ9UMR7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms