Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATPIF1Q9UII2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms