Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4Q9UBX2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4Q9UBX2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms