Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPRMQ9NS64 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPRMQ9NS64 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms