Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BIN3Q9NQY0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms