Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms