Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRDM12Q9H4Q4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRDM12Q9H4Q4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms