Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRCC1Q9C099 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms