Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms