Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms