Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP3-1Q9BYR8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms