Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms