Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THUMPD2Q9BTF0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms