Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EBF4Q9BQW3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms