Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMSS1Q9BQ75 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms