Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms