Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms