Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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