Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPD52L3Q96J77 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms