Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPNQ96H22 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms