Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF428Q96B54 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF428Q96B54 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms