Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 KIAA0141-205ENST00000507481 1342 ntTSL 511.8□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 CP-210ENST00000481169 3411 ntTSL 26.69□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 CP-212ENST00000490639 3105 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.563e-8■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.613e-8■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 CP-213ENST00000494544 2806 ntTSL 1 (best)4.91□□□□□ -1.623e-8■■■■■ 46.1
TBRG4Q969Z0 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 46
TBRG4Q969Z0 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 46
TBRG4Q969Z0 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 46
TBRG4Q969Z0 MTSS1-212ENST00000522162 553 ntTSL 46.38□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 46
TBRG4Q969Z0 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 45.9
TBRG4Q969Z0 PFAS-205ENST00000580356 4242 ntTSL 212.89□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 45.9
TBRG4Q969Z0 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 45.9
TBRG4Q969Z0 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 45.9
TBRG4Q969Z0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-11■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 HDAC10-204ENST00000429374 1634 ntTSL 1 (best)18.95■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 DMKN-214ENST00000450261 364 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.22■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 EPAS1-207ENST00000467888 665 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 NT5C2-207ENST00000461461 902 ntTSL 517.61■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-11■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 HDAC10-203ENST00000415993 2375 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 415.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 PRKDC-203ENST00000432581 583 ntTSL 214.42□□□□□ -0.15e-16■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 SLC4A1AP-204ENST00000613058 2966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 MRPL1-201ENST00000315567 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 C16orf70-209ENST00000569626 2835 ntTSL 26.99□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 45.8
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TBRG4Q969Z0 MAU2-206ENST00000587362 557 ntTSL 44.8□□□□□ -1.642e-11■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 NT5C2-205ENST00000452156 856 ntTSL 54.15□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 45.8
TBRG4Q969Z0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 45.7
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TBRG4Q969Z0 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 45.7
TBRG4Q969Z0 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 45.6
TBRG4Q969Z0 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)5.97□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 45.5
TBRG4Q969Z0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 45.3
TBRG4Q969Z0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 45.3
TBRG4Q969Z0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 45.3
TBRG4Q969Z0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 45.2
TBRG4Q969Z0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 45.2
TBRG4Q969Z0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 45.2
TBRG4Q969Z0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 45.2
TBRG4Q969Z0 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 45.2
TBRG4Q969Z0 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 45.2
TBRG4Q969Z0 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.61□□□□□ -1.511e-12■■■■■ 45.2
TBRG4Q969Z0 CHFR-218ENST00000540963 875 ntTSL 225.94■■□□□ 1.744e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 325.71■■□□□ 1.714e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 TEAD4-207ENST00000543035 801 ntTSL 525.27■■□□□ 1.645e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.494e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 TTC3-217ENST00000481605 1540 ntTSL 522.77■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 R3HDM2-208ENST00000448732 195 ntTSL 1 (best)22.49■■□□□ 1.199e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 TTC3-210ENST00000450533 2451 ntTSL 1 (best)21.98■■□□□ 1.114e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 519.72■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 517.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 AP2A2-221ENST00000531548 554 ntTSL 416.87■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 TTC3-209ENST00000438055 3606 ntTSL 516.62■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 45.1
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