Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFKQ969G6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms