Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHMTQ93088 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms