Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms