Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC12Q8WUD4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms