Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHE23Q8NDY6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHE23Q8NDY6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms