Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3BQ7Z3V4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3BQ7Z3V4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms