Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTOP1Q7RTM1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms