Protein–RNA interactions for Protein: Q711Q0

C10orf71, Uncharacterized protein C10orf71, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf71Q711Q0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf71Q711Q0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms