Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
BBS12Q6ZW61 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BBS12Q6ZW61 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BBS12Q6ZW61 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms