Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1TD1Q5T7N2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1TD1Q5T7N2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms