Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PHYHD1Q5SRE7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms