Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM74A1Q5RGS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms