Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOHLH1Q5JUK2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms