Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms