Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms