Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms